1979年剛滿15歲的鄒慧君進入無錫輕工業學院學習，當時填的志愿是熱門的輕工機械與自動化，不料被調劑到食品工程系發酵專業學習，進校體檢時又不知怎的就是聞不出酒精味，差點又讀不成這個對嗅覺要求較高的專業了，時至今日已成為國家級黃酒評委的她還經常笑談起這段往事。

　　1983年畢業后，唯獨未學過黃酒生產的鄒慧君，卻偏被分配至紹興市釀酒總廠工作。當時總廠年產黃酒不到一萬噸，生產以手工操作為主，工人還不到二百個，惡劣的環境讓她萌生了不干的念頭。當時總廠的黨委書記劉金柱對這批年輕的大學生極為關心，廠里的工人師傅們對這位當時企業里唯一的女大學生十分熱情，生活上的熱心照顧、工作上的悉心幫助，特別是職工們對黃酒的熱愛及工作熱情深深地感染了她，通過對黃酒的不斷了解，慢慢地接受了它，也喜歡上了它。

　　進廠后先在各生產車間見習了一段時間，開始了解和熟悉黃酒的生產和相關工藝。黃酒生產在世人眼中有點神秘，因為有許多東西都是只知其然而不知所以然，黃酒生產顯得十分古老，因為當時的生產工藝好多還是師授徒傳的傳統方法，這些都深深的激起了鄒慧君的興趣，也使她覺得要了解黃酒的生產、要改變落后的技術，需要新一代黃酒技術人員的不斷努力。

　　1984年，鄒慧君擔任當時第一個紹興酒生產的機械化生產萬噸車間的施工及生產工藝員，這在當時是一個很大的改革與創新，因為當時雖說機械化生產開始在黃酒生產中逐步推行，但在紹興酒的生產中還是首創。通過大家不斷地摸索與實驗，通過學到的理論知識與實踐的接合，使這一車間順利進行試生產，首批就生產出優質的紹興酒，在此基礎上，制訂了切實可行的操作規程及作業指導書等一系列的工藝文件，首次使紹興酒的生產標準化、制度化，保證了生產的穩定。

　　1992年，公司第二個機械化車間兩萬噸黃酒車間又開始籌建，鄒慧君負責黃酒勾兌工作，對黃酒的品評與勾兌有了較多的接觸與經驗，她的評酒技藝也在不斷的實踐中得到了提升，對黃酒的生產實際也有了進一步的了解。

　　1994年，紹興黃酒集團公司成立，鄒慧君進公司科研所工作，這是黃酒企業內第一個研究部門，主要從事相關的黃酒科研工作，在這里，她與同事們一起完成了“復合酵母在機械化黃酒中的應用”和“黃酒制曲新工藝的研究”課題的研究，前一個課題是從傳統的紹興酒醪中選育出發酵快、口味優的幾只酵母品種，復合培養后應用于新工藝黃酒的生產，后一個課題是一般機械化黃酒生產由于是大罐發酵，僅靠傳統的塊曲由于液化率、糖化力較低可能造成發酵的緩慢從而造成酒的酸敗，所以一般需加一定量的熟麥純種曲，但后者易造成酒味稍苦。針對這一情況，項目組用生麥接種純種曲種的方法，一方面使曲中存在一定量的其它菌種，一方面改善麥蒸熟后的一些口味變化，這兩個課題在生產上應用后解決了機械化生產的黃酒由于純種酵母及純種培養曲使其口味相對淡薄及苦味較重的缺點，使機械化生產的黃酒口味完全與傳統生產的紹興酒相一致。這兩個課題先后獲得了省科技進步獎。在此以后“機械化黃酒酵母的選育…黃酒糟生產纖維素酶并在黃酒生產中應用”等一大枇科研課題通過鑒定并在生產中應用，解決了一些黃酒生產中的實際問題。

　　1996年，憑著對黃灑的扎實的理論基礎和豐富的實踐經驗，憑著平時對其它種類黃酒的關注及學習，憑著掌握的各種評酒知識，鄒慧君順利地通過了為期五天的理論及實際評酒考試，以第一名的優異成績被聘為國家級黃酒評委。

　　1997年，進公司質量管理部工作，主要負責公司各檔成品酒的勾兌、配方制定、新產品開發及質量管理工作。為此，鄒慧君對當時的幾百個品種、分布在二十多個倉庫中的陳酒全面進行了調查，對每個品種的酒進行品嘗歸類，建立了庫存酒檔案，在此基礎上確定了庫存酒的方案，對每個產品的配方進行完善并定期進行更改，對現有的品種根據市場要需求進行配方的確定，應用了系統的勾兌及配方管理，使公司成品酒質量穩定提高。在此基礎上主持開發狀元紅等幾十只新產品，結合了先進的生物技術，使黃酒這一傳統產品有了新的面貌與內涵。開了公司黃酒產品營養、低度的先河，目前市場上營養、低度型黃酒日益增多，為企業帶來了豐厚的利潤，“古越龍山”酒的聲譽在市場上日益增加。1999年“古越龍山”獲中國馳名商標稱號。

　　2000年，公司成立質量技術中心，鄒慧君擔任了質量技術中心主任，負責公司的質量管理工作，主持公司的IS09001、14001及HACCP工作，使企業在同行業內率先通過了ISO國際標準及HACCP的認證工作。為提高黃酒的技術含量，解決一些長期困擾行業的老大難的問題，鄒慧君與同事們積極進行黃酒的技術研究工作，在主管公司的科研工作中，主持開發了“金五年”、“五十年陳花雕酒”等幾十只新產品，在市場銷售取得了極大的經濟效益，成了公司新的利潤增長點。為解決黃酒沉淀的老大難問題，先后進行了“紹興黃酒非生物穩定性研究”、“紹興黃酒沉淀機理機理的研究”、“冷凍膜過濾技術在生產中的應用”等課題，從而在生產過程中進行相應的控制，提高黃酒生產技術和產品品質，同時通過各種澄清劑的試驗、微濾及超濾試驗等工作，確定了適合黃酒生產的溫度、時間的冷凍貯存及適宜孔徑微濾技術，在生產中應用后取得較好的效果，使解決黃酒沉淀成為可能。為解決黃酒生產后廢糟水的處理，減少環境污染，先后進行了“用黃酒糟生產纖維素酶并應用于黃酒生產”、“酒精糟水和浸米漿水的回收利用”等課題的研究，減少廢水排放，節約投料用水，提高了黃酒及以后黃酒副產品糟燒的出酒率。

　　黃酒的生產已有幾千年的歷史，但黃酒中到底有多少組成成分卻并沒有一個完整的數據，特別是黃酒在民間常作為藥引使用，適量常飲有益于健康也被人們所公認，為此，鄒慧君他們又進行“紹興黃酒功能性成分分析”、“紹興黃酒功能性成分的臨床應用”等課題，從而分析到黃酒中富含多量有益于人體健康的功能性物質，使消費者對黃酒的保健功能有了新的了解，從而使人們對黃酒營養有新的認識。“早秈糯品種改良利用及配套釀酒技術試驗研究”、“無菌灌裝與純生黃酒工藝的研究”、“優質釀酒專用糯稻新品種中試與產品開發”、“羅口蓋防霉技術研究”等等一系列研究課題的成功鑒定及應用使紹興黃酒的生產從原料、生產、包裝都有了新的發展，這些課題中的許多都通過省、市及鑒定并先后獲省、市科技進步獎，中國紹興黃酒技術中心也成為黃酒業內第一個省級技術中心，目前正在積極申報國家級技術中心，以期望為黃酒事業的發展做出更多的成績。

　　在繁忙的工作中，鄒慧君也沒有放棄自己的學習與業務素質的提高，她常參加不同的培訓以提高自己各方面的素質，從生產實踐中不斷提高自己的專業技術水平。為提高公司的檢測水平，積極引進先進的檢測技術，并努力探索新的檢測方式。近年來公司先后購置了氣質聯用色譜儀、液相識譜儀、ICP等離子光譜發射儀等高新設備，為此鄒慧君與其他同事一起，刻苦學習掌握相應的檢測方式，使公司的檢測能力下水平一直處于行業之先，能及時應對顧客的新需求，不斷滿足市場的發展要求，同時使公司對黃酒的研發能力有了很大的提高。為不斷提高自己的評酒水平，她又參加了黃酒品評的高級研修班，學習國內外感官品評的新知識，她的多篇論文在《釀酒》、《釀酒科技》、《中國釀造》及《中國黃酒》等雜志發表，并評為省質協論文一等獎及釀酒工業協會黃酒分會論文評選一、三等獎。她還十分注重于專業人才的培養工作，每年在公司舉辦的培訓班中，為質量管理人員講授評酒知識及質量管理知識；為銷售人員講授釀酒專業知識；對技工及管理人員進行全面質量管理知識的培訓；在釀酒工業協會的評酒員培訓班上進行評酒員的培訓；在市酒文化研究會及公司與市職教中心合辦的大專班上講授有機化學、釀酒知識等，為公司培養了一大批專業人才，同時還指導公司各分廠的QC小組活動，使公司的oc成果取得了很大成績，每年都有成果獲國家、省級優秀獎。

　　畢業二十多年來，鄒慧君一直從事黃酒的生產、管理工作，對黃酒知識從不熟悉甚至算得上一竅不通，還由于在看到當時破舊的廠區、落后的生產方式時，后悔自己選錯了專業、進錯了廠門，到在工作中逐漸的了解、熟悉了黃酒的生產過程，她深深地領會了黃酒這一民族精粹豐富的文化內涵，進而喜愛乃至于沉醉其中。這期間，有過幾多艱辛，更有過許多快樂。經歷了公司從剛進來時的一百多人到現在三千多人，從生產不到一萬噸黃酒到目前十多萬噸的年產量，黃酒生產的技術越來越先進，廠房設備越來越現代化，鄒慧君有許多感慨。她說：“我們這一代人是幸運的，因為我們生活在人們生活水平不斷提高的和諧社會中，應該說真正見識了中國黃酒事業的發展，特別是隨著人們生活水平的提高，黃酒的低度、營養及其豐富的酒文化越來越被消費者喜愛，黃酒已從原有的區域化的消費向全國市場乃至國外發展，黃酒的社會地位在不斷提升。黃酒這一民族產業能與時俱進，越來越為國內外消費者所接受、所喜愛，我們堅信黃酒會不斷的發展，我們的事業一定大有可為。”

　　1979年在無錫輕工業學院學習，1983年大學畢業進入紹興市釀酒總廠工作；1994年紹興黃酒集團公司成立，進公司科研所工作；2000年在公司擔任質量技術中心主任；2003年擔任副總工程師兼質量技術中心主任。

　　2004年獲中國釀酒工業協會百名先進個人榮譽；2004年，成為紹興市第五批市級撥尖人才、專業技術學術帶頭人，同年被聘為釀酒工業協會黃酒分會技術委員會成員、專家委員會成員；繼聘為第七屆國家黃酒評委；2007年又被評為市第六批高級拔尖人才、專業技術學術帶頭人。

　　2005年被江南大學（原無錫輕工業大學）生物工程學院聘為兼職教授，并擔任了了紹興市質量協會常務理事。市技術市場促進會常務理事、浙江省商標協會理事、紹興市食品安全咨詢組專家、浙江省科學技術學會會員等學術團體職務。